Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms