Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms