Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SphkapQ6NSW3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms