Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms