Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep78Q6IRU7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms