Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms