Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms