Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ParpbpQ6IRT3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms