Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q6DFW0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms