Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms