Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc2Q69ZB8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms