Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms