Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VclQ64727 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VclQ64727 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VclQ64727 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VclQ64727 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms