Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sdc3Q64519 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sdc3Q64519 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sdc3Q64519 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sdc3Q64519 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sdc3Q64519 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sdc3Q64519 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Sdc3Q64519 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Sdc3Q64519 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Sdc3Q64519 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Sdc3Q64519 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Sdc3Q64519 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Sdc3Q64519 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc3Q64519 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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