Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tbr1Q64336 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tbr1Q64336 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms