Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms