Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms