Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc18Q640L5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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