Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga3Q62470 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms