Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20854Q62461 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20854Q62461 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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