Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf6Q62311 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf6Q62311 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms