Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms