Protein–RNA interactions for Protein: Q62252

Spa17, Sperm surface protein Sp17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spa17Q62252 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spa17Q62252 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spa17Q62252 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms