Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema3cQ62181 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms