Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm38Q62176 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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