Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcbp2Q61990 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcbp2Q61990 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms