Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ifi47Q61635 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ifi47Q61635 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ifi47Q61635 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ifi47Q61635 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ifi47Q61635 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ifi47Q61635 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ifi47Q61635 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ifi47Q61635 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ifi47Q61635 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ifi47Q61635 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi47Q61635 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms