Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1aQ61495 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms