Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna2Q61301 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms