Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik1Q60934 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik1Q60934 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms