Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms