Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stxbp3Q60770 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms