Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atf3Q60765 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf3Q60765 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms