Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mkrn3Q60764 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mkrn3Q60764 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms