Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd4Q60688 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd4Q60688 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms