Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms