Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms