Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms