Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Sco1Q5SUC9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Sco1Q5SUC9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Sco1Q5SUC9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Sco1Q5SUC9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Sco1Q5SUC9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms