Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms