Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms