Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sun3Q5SS91 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sun3Q5SS91 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms