Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim58Q5NCC9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim58Q5NCC9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms