Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm12253Q5NC48 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm12253Q5NC48 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm12253Q5NC48 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm12253Q5NC48 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm12253Q5NC48 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm12253Q5NC48 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm12253Q5NC48 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm12253Q5NC48 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm12253Q5NC48 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm12253Q5NC48 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm12253Q5NC48 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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