Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C4

Vps13a, Vacuolar protein sorting-associated protein 13A, mousemouse

Predictions only

Length 3,166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13aQ5H8C4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vps13aQ5H8C4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps13aQ5H8C4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps13aQ5H8C4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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