Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms