Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Urb1Q571H0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Urb1Q571H0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Urb1Q571H0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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