Protein–RNA interactions for Protein: Q571E5

Prss53, Serine protease 53, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss53Q571E5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss53Q571E5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss53Q571E5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms