Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spire1Q52KF3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms