Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms